유령을 쫓거나 불가사의한 사건을 해결해온 ‘미스터리 주식회사’의 맴버들은 성격차이로 서로 뿔뿔이 흩어진 지 2년 후, 다시 ‘미스테리 주식회사’를 재결성해서 ‘스푸키’ 섬에서 발생한 또다른 사건을 맡게 된다.